支援内容

De novoゲノムシーケンス

De novoゲノムアセンブリ

参照配列のない新規生物種のゲノムを、NGSデータを用いて構築します。

ゲノムアノテーション
ゲノム配列上の遺伝子の位置やエキソンーイントロン構造を同定し、注釈付けします。

ゲノムリシーケンス

全ゲノムリシーケンス
全ゲノムの配列リードを参照ゲノム配列と比較し、SNVや構造多型を検出します。
ターゲットゲノムリシーケンス・エピジェネティクス解析
エキソーム、RAD-seq、ChIP-seq、HiC-seq等々。

トランスクリプトーム解析

遺伝子構造・発現解析
RNA-seqデータのde novoアセンブル・マッピングを通して、遺伝子構造同定や発現量解析を行います。
non-coding RNA解析
RNA2次構造予測、miRNAのターゲット検索など。

メタゲノム解析

メタゲノムアセンブリ
メタゲノム配列リードをde novoでアセンブルします。
種分類、遺伝子予測
メタゲノム配列のクラスタリング、遺伝子予測、パスウェイ解析など。

その他の解析

その他、ゲノムDNA・RNAデータ解析全般。